三年之后，慕言让二十五名选出来的弟子守住琼华，然后让另外一百五十名弟子，每十人一个大队，两人为一小组潜入各国打探情报。 最后经过所有人又是三年的不懈努力，成功阻止晓的挑拨。 带土一怒之下改变策略，寻找其他成员加入。 用直接潜入的办法，收服人柱力。 就在同一时间，止水被团藏夺眼，为了宇智波和木叶的和平，他选择了自杀身亡。 他的自杀，让宇智波鼬开启了万花筒写轮眼。 而且在宁死前说出南贺神社秘石里面藏有三件神器，他把这三件神器和自己的眼睛托付给了宇智波鼬，还让鼬最好不好使用须佐能乎。 因为须佐能乎会吞噬人的心智，这就是止水为什么不用须佐能乎的原因。 带土怎么也没有想到，宇智波鼬居然成功破解南贺神社秘石封印，神器被宇智波鼬所得。而带土之所以没拿到神器，那是因为他是十三岁才开眼，精神力不够，破解不了秘石的封印。 他为了使宇智波鼬变得堕落为他所用，杀了宇智波所有人，最后假装想要杀了放学的佐助，宇智波鼬成功使用出须佐能乎与他一战。 带土成功遁走，心智迷失的宇智波鼬，杀了自己的父母。 就在他想要杀了佐助的时候，慕言及时赶到，把宇智波鼬成功唤醒。 宇智波鼬为了给父母报仇，甘愿潜入晓当卧底。 就在这时，照美冥联络慕言，慕言赶了过去，带领大家跟三尾战斗。 战斗刚要打响，玲羽也发出了紧急联络信号。 两军对战，临阵换帅乃是兵家大忌，慕言无法离开，只能派龙溟回转。 可惜三尾实力太强，最后虽然被慕言所杀，但慕言用尽了法力，三尾准备逃走，被带土所擒。 就在这时，河豚鬼从一旁杀出，目标是照美冥。 照美冥查克拉早就不够，慕言焚心剑还在三尾身上来不及拔出，用刚恢复的一丝法力使用御风诀用身体替照美冥挡下了这一击，顺手给了河豚鬼一拳。 河豚鬼被一拳打成重伤，最后被鬼鲛所杀。 照美冥虽然被慕言所救，但慕言后背的伤口触目惊心，英雄救美桥段虽老，但十分有效。 慕言成功捕获少女芳心。 这点伤对慕言实在不算什么，回转之时发现白绝和蝎正在进攻琼华，却被龙溟和玲羽联手击退。 三天之后，慕言伤已完好如初，佩恩被十尾所侵蚀，想抓九尾，被赶来的慕言与他对决，对战中佩恩消耗过大，被慕言成功唤醒。 本以为皆大欢喜，可是长门却突然被带土偷袭，失去了轮回眼，小南用丹药救人，成功带着长门逃了出来。 长门失去眼睛，不过身体已经恢复如初。 慕言遇到自来也，恢复到七转七层，从蛤蟆口中得知，天地灵气和自然能量不是同一个世界的东西，所以慕言无法感知自然能量，这个世界的人也无法感知天地灵气。 恢复功力的慕言带着龙溟直接约见大蛇丸，龙溟轻松击败大蛇丸，得知龙地洞的位置，最后恢复到八转四成。 不过大蛇丸却知道了慕言的秘密，研制出了完美的秽土转生，可以复活所有忍界英雄，包括斑，和金角银角。 同时带土也得到眼睛发起总攻，没想到河之国却成了一道屏障。 不过五大国只有三代火影和照美冥带人支援。 慕言斩了死神，复活四代，破了变形山结界，救出猿魔。 加上阵法与一百五十名可以御剑的弟子。 带土无法攻破，最后没有办法，只好先攻破其他三国，除了九尾，所有尾兽都已经有了。 利用金角银角的力量，将十尾复活。 其他三国剩余的人，全部转移到火之国。 河之国成了决战场地。 有了空间之力的阴阳五行八卦阵，却成了一座堡垒，加上慕言恢复的空间之力，吸收所有白绝的灵气恢复到八转九层。 斑解除秽土转生，最后，慕言用空间之力击败带土。 斑成功夺眼，夺眼之后，与五影一战，纲手被斑斩成两段，却被龙溟所救，纲手终于爱上龙溟。 慕言击败十尾，很快赶来与斑一战，斑吸收十尾，变成六道之力的斑。 慕言用出从来没使用过的轩辕剑，惊天一剑将斑劈成重伤。 黑绝乘机偷袭，辉夜姬重现人间。 慕言早就知道，用离魂阵，剥离出辉夜体内的邪恶气息。 辉夜恢复神智。 邪恶气息凝聚成须佐能乎。 原来须佐能乎三千年前率领八百万众神，进攻东方神界，刚好碰到封神榜册封完毕，被托塔李天王，哪吒，杨戬，四大天王直接击退。 利用自己的空间之力，逃到了这个地方。 在这个世界，他杀了自己的哥哥天照，把姐姐月读封印在了宇智波的石碑里面。 在杀天照的时候，被天照大神宁死反扑消耗完了他的神力，他神力虚脱最后化身成为神树。 两千年后，辉夜奉命前来找天照等神，被众神合力送来这个空间。 在这里，他发现了神树，知道了一切。 可惜在这个途中，他爱上了一个人类。 人类开始了无休止的战争。 她想要保护这里的每一个人，可惜她来这里之后时候，神力消耗的差不多了。 须佐能乎骗她吃下果实。 吃下果实的辉夜，身上有了须佐能乎的力量。在生下羽村和羽衣的时候，须佐能乎成功压制辉夜的灵魂，夺得身体控制权。 六道仙人已经有了须佐能乎的邪恶力量，他虽然能压制这股力量，但他儿子不能。 宇智波一族就是有邪恶力量的子孙。 被控制了的辉夜，把所有人都改造了一遍。 可惜天地灵气不是这个世界的东西，她做实验用了很大一部分。 最后终于成功了，辉夜一族的确是她的失败品。 须佐能乎吸收了六道之力，轮回眼，万花筒写轮眼，辉夜的空间之力和宇智波一族七种须佐能乎的力量。 恢复善良的辉夜姬，帮助慕言加入战斗。 慕言，龙溟，辉夜经过一番苦战，终于战胜了所有能力集合一体的须佐能乎，可惜须佐能乎回光返照十拳剑偷袭慕言，却被玲羽所挡。 玲羽阵亡。 十拳剑所杀，直接伤及灵魂，无法复活。 慕言一怒之下，全力一剑终于斩了须佐能乎。 就在灵魂要消散的那一刻，龙溟提醒，用金角银角手中抢的紫金葫芦保住玲羽的灵魂，回去让天尊想办法。 慕言只有八转九层，不过辉夜的空间之力的确了得，在所有忍界忍者的帮助下，开启了回地球的通道。 慕言悲伤的带着猿魔龙溟和玲羽的灵魂回到了现实世界。 照美冥和纲手依依不舍。 就在慕言回去的那一刻，火影世界所有人都失去了对慕言等人的记忆。 三年之后。 这段时间，纲手一直不愿意谈恋爱，因为她心中住着某人。 照美冥不知为何，有过很多婚约，但都被她推掉。 她经常会做一个梦，梦到自己和一个男人结婚了，可是她只记得那人的长相，就是说不出那人的名字。 直到有一天，这个男人微笑的出现在她面前，他的身后还跟着一个冷艳绝美的女子。 她毫不犹豫的扑进了这个男人的怀里。（完）