在纽约市的地下世界，一股神秘而令人不安的黑暗氛围逐渐弥漫开来。街头的路灯仿佛失去了往日的明亮，被黑暗吞噬。这个曾经繁荣与和平的城市，如今却笼罩在一片漆黑之中，仿佛被无尽的黑暗力量所笼罩。

在这片黑暗的世界中，四只勇猛的忍者神龟——拉斐尔、米开朗基罗、唐尼和莱昂纳多，以及他们的智者老师斯普林特，只来自日本的超级大老鼠，感受到了即将到来的危机。他们的训练和战斗经验告诉他们，这股神秘的黑暗并非寻常，可能是一场更大的阴谋的开始。

在他们的秘密根据地中，四只神龟和斯普林特老鼠聚在一起商讨对策。他们意识到，要想对抗这股黑暗的力量，首先需要找到它的根源。

“这股黑暗仿佛是一种邪恶的魔法所释放的。”莱昂纳多皱起了眉头。

“我们得小心行事，这种黑暗魔法可能是来自一个强大的敌人。”拉斐尔紧握着手中的双刀，目光坚定。

斯普林特老鼠的双眼闪烁着思考的光芒，他试图借助他的智慧来揭示黑暗的起因。

然而，城市的黑暗局势却在持续恶化。人们感受到了黑暗的威胁，街道上弥漫着一种诡异的恐惧氛围。居民们互相交流着，试图找到黑暗的根源和解决方法。

于是，忍者神龟们决定深入城市的地下世界，逐一寻找黑暗的线索。在一处废弃的地下仓库中，他们发现了一些奇怪的痕迹。

“这些痕迹似乎是黑暗魔法所留下的。”米开朗基罗指着地上一堆被黑暗笼罩的物体说道。